张晓原表示，此次改革将明晰政府与市场的关系。政府重点支持市场不能有效配置资源的公共科技活动，对其他量大面广的、企业自主的项目以普惠性政策和引导性为主的方式支持企业技术创新活动和成果转化。

政府将在顶层依托专业机构管理项目实现“放手”。张晓原表示，将组建一批专业化项目管理机构，通过国家科技计划管理信息系统，受理项目申请，组织项目评审立项，过程管理和验收。

“不是科技部集中管理，也不是原来各管各的，整个资源通过联席会议制度进行管理。”张晓原说，通过建立由科技部门牵头，财政、发改等相关部门参加的科技计划（专项、基金等）管理联席会议，共同制定议事规则，负责审议科技发展战略规划、科技计划（专项、基金等）的布局与设置、战略咨询与综合评审委员会的设立、专业机构的遴选择优等事项。

财政部教科文司司长赵路表示，在科技计划的管理上，往高站一层，往后退一步，干政府该干的事。往高站一层，将来政府部门科技管理重点管宏观、管规划、管政策、管布局、管监督、要效率。往后退一步，政府不再直接管项目，分配项目经费、课题经费，杜绝“跑部钱进”。

全国人大常委会副秘书长李连宁表示，现在一些科技、课题带头人掌握着大量资金，他们自主支配，因此称谓也在变化，不叫科学家，而改称老板。对此，应该结合即将出台的新规，解决部门空间内存在权力寻租、高校教师话语权相对较弱等问题，使得我国有限的科研经费真正用在刀刃上，让纳税人的钱能够在国家发展、国家技术创新上发挥事半功倍的作用